Cikal bakal YAPPIKA berawal sejak tahun 1991 dengan terbentuknya Yayasan Persahabatan Indonesia Kanada (YAPIKA) atau Forum Indonesia-Kanada ( the Indonesia-Canada Forum ). Fungsi YAPIKA saat itu adalah sebagai lembaga yang menyalurkan dana untuk LSM-LSM di Indonesia, dengan kepengurusan kolektif antara organisasi-organisasi non-profit Indonesia dan Kanada.

Dalam perkembangannya, tepatnya pada tahun 1997, YAPPIKA mengalami perubahan menjadi sebuah lembaga Indonesia, masuk dalam barisan ORNOP Indonesia, dan menambah peran-perannya di bidang peningkatan kapasitas lembaga-lembaga non-profit, sekaligus mulai aktif dalam kancah advokasi nasional untuk isu-isu tertentu yang menjadi fokus perhatiannya. Singkatan nama YAPPIKA pun berubah menjadi Yayasan Penguatan Partisipasi, Inisiatif dan Kemitraan Masyarakat Indonesia. Seiring dengan pergantian pemerintahan pasca reformasi, Yappika makin intensif meningkatkan kapasitas organisasi untuk dapat mengawal proses transisi demokrasi di Indonesia. Pada tahun 2000, Yappika mengukuhkan diri sebagai Aliansi Masyarakat Sipil Indonesia untuk Demokrasi. Sejak saat itu, nama Yappika bukan lagi sebuah akronim, tetapi menjadi sebuah nama organisasi.

PENDIRI / MAJELIS ANGGOTA :
- Badan Koordinasi Koperasi Kredit Kecil Indonesia (BK3I)
- Bina Swadaya
- Kalyanamitra
- Lembaga Penelitian, Pendidikan dan Penerangan Ekonomi dan Sosial (LP3ES)
- Perhimpunan Keluarga Berencana Indonesia (PKBI)
- Perhimpunan Pengembangan Pesantren dan Masyarakat (P3M)
- Sekretariat Bina Desa
- Yayasan Dian Desa
- Yayasan Lembaga Konsumen Indonesia (YLKI)
- Yayasan Pengembangan Masyarakat Desa - Irian Jaya (YPMD)